एनसीईएल को चार प्रमुख सहकारी समितियों अर्थात जीसीएमएमएफ, इफको, कृभको और नेफेडतथा सांविधिक निगम एनसीडीसी, द्वारासंयुक्त रूप से प्रमोट किया गया है  और प्रत्येक द्वारा प्रारंभिक चुकता पूंजी के रूप में ₹ 100 करोड़ का निवेश किया गया है। एनसीईएल की अधिकृत शेयर पूंजी ₹ 2000 करोड़ है। प्राथमिक से लेकर राष्ट्रीय तक सभी स्तरों पर सहकारी समितियाँ, जो निर्यात गतिविधियों में रुचि रखती हैं, सदस्य के रूप में एनसीईएल में शामिल होने के लिए पात्र होंगी।

एनसीईएल का पंजीकृत कार्यालय नई दिल्ली में है। एनसीईएल की सदस्य संरचना, जैसा कि नीचे दी गई तालिका में दर्शाया गया है, छह वर्गों में विभाजित है तथा प्रत्येक वर्ग का संगठन में अपना न्यूनतम योगदान है: -